小帝国的战斗中唯一能手动操作的就是英雄的魔法技能，每个英雄出生都自带一个默认的魔法崩裂巨刃，更多魔法技能就需要魔酒买。购买的魔法可以在英雄坛中进行装备与调整。要注意，小小帝国魔法跟装备一样，需要使用金币水晶或魔酒来维修，或者说充能。否则会像装备一样损坏不可用。
使用魔法只要点击一下魔法图标就可以用了。使用魔法唯一的限制就是冷却时间，也就是CD(cooldown)，有一些装备可以提升技能冷却时间，这样的装备可以让你更快的放出魔法。
我们将技能分为6类，分别为：
混战(施放魔法技能的时候不需要选择目标，施放范围内的目标全部都会被命中)
直线冲击(施放魔法技能的时候不需要选择目标，魔法技能会沿着英雄正前方伤害一整条直线)
召唤(施放魔法技能的时候不需要选择目标，会召唤一些兵种灵魂出来战斗)
范围杀伤，AOE(施放魔法技能的时候要选择施放魔法的位置，会伤害所选择位置一整个区域的目标)
巫术(施放时候会自动选择攻击的位置，玩家无法控制该类技能的攻击目标)
其他
小小帝国魔法技能术语
最多攻击目标：某一个魔法可以杀伤的最多目标个数。
最大伤害：魔法技能命中最多个目标所造成的总伤害。
最大单体伤害：魔法技能命中一个目标时候造成的最大伤害
基础冷却时间：在没有任何加速魔法冷却速度的装备情况下，技能需要冷却的时间
打断：一些魔法技能带有轻微的眩晕打断效果，命中的时候通常会打断目标的正在进行的动作，使得目标必须重新开始。例如加血需要2秒，快到2秒的时候被打断，那么牧师就需要从头开始准备加血动作。