封印之城黑暗根源起源介绍，因为十年前的恶魔召唤异变，除了导致东京区域近乎全毁之外。并且遗留下了后遗症，当初异变后四散在东京各处的黑暗能量，会有一定机率转化成黑暗根并攻击遭遇的契约者。
各位契约者们有机会在进行地图探索时遭遇到「黑暗根源」，并且随着遭遇次数越多，「黑暗根源」会变的越强悍。
遇到时可以选择跟「黑暗根源」进行对战或是逃跑，若是进行对战的话，则会以现有的恶魔队伍迎击「黑暗根源」。
与「黑暗根源」进行对战后若不幸落败也无妨，因为战败后系统会自动传送讯息给你的好友契约者，收到求救讯息的契约者，可以帮助你进行一次不用消耗光能的对「黑暗根源」迎击战，只要有参与到「黑暗根源」迎击战的契约者无论胜败都可以获得大量的经验值与银币。所以各位契约者们若是遭遇「黑暗根源」的话，建议还是迎击会比较划算喔。