巅峰战舰为各位舰长提供了两种操作模式一种为自动模式，一种为手动模式，自动模式又可称为“辅助驾驶模式”，使用该模式时各位舰长大大只需调整行驶的4种档位及控制战舰左右转向即可轻松操作。
自动模式操作分为挂挡和转向两个操作
在巅峰战舰中每艘战舰都拥有4个档位：全速前进、半速前进、停止、倒退。当选择全速前进时，战舰将以最大速度行驶;当选择半速前进时，战舰将以最高航速的一半行驶;当选择停止时，战舰将停止动力供应进行自然减速至停船;当选择倒退时，战舰将以较慢速度后退;
需要注意的是不同战舰的换挡都拥有不同的响应时间，大型战舰(战列、航母)的响应时间较长，中、小型战舰的响应时间较短(巡洋、战列)，该设定完美的还原了现实中不同战舰的驾驶感受。各位舰长可过在档位上下滑动进行档位操作，挂挡完成后，无需进行其他操作，战舰即可以对应档位速度前进倒退。
在实际战斗中一直向正前方前进那么转向就成为了必不可少的操作在挂挡左右两边的扇形区域即为我们的转向按钮，在进行转向时需按住转向按钮方可进行完整的转向操作和挂挡一样不同战舰的转向速度也是不一样的，一般来说驱逐舰这类灵巧的战舰转向速度要远好于战列。
手动模式
手动模式是提供给更加追求操作和个性化的船长准备的。操作相比自动模式，要复杂一些，但是随之而来的好处是可以让舰长更加细致的操作自己的战舰。这在混战中可以带来巨大的优势。手动模式并不存在挂挡选项，玩家的手必须时刻按住对应区域。一旦离开操作位置，战舰将停止运动。而左右的转向操作，则需要舰长在按住前进的同时，将前进按钮左右移动至弯角指针处，方可进行转向操作。战舰的手动/自动操作模式，可在游戏战斗界面左下角点击，可根据自身喜好切换。
