由于新世纪福音战士手游是对原作动漫的高度还原，因此动漫中的很多剧情和属性在游戏中也会出现。与原作一样，在游戏中驾驶员与EVA之间具有同步率这一属性。下面我们来一起了解一下同步率这一属性游戏中起着怎样的作用。
消耗“神经元激发素”可以提高驾驶员与EVA之间的同步率，百分比增加驾驶员的生命，攻击，防御。在达到同步率50%和同步率80%的条件时分别会获得强大的攻击或者防御属性。
EVA的同步率与驾驶员的一样，只是EVA所用的消耗品不一样。EVA通过消耗“核心激发素”提高与驾驶员的同步率，百分比增加EVA的生命，攻击，防御。在达到同步率50%和同步率80%的条件时分别会获得强大的攻击或者防御属性。
适格者与EVA组合时的组合同步率比其他搭配基础高，组合战力也会有所提高。