剧情设定目标：让舰娘们的存在合乎情理，并且反法西斯，有剧情，有人物个性，延伸游戏的内涵。二战原子弹爆炸后留下一对受辐射夫妇的儿子。因为父母DNA被辐射变异，导致其智商超高但外表丑陋(参考霍金，但能动)， 生来即被遗弃，一生被社会歧视虐待，对J国和U国苦大仇深，(认为原子弹和侵略战争是造成自己痛苦的根源)。因为丑陋，极度自卑和封闭，以常人数十倍的天赋与时间投入刻苦学习钻研各种科技，梦想是让自己变成万千女性的偶像，现实中暗恋养父母的女儿们。
公元202x年，J国在美国的支持煽动下企图奇袭中俄，形成美日世界霸权核心，然而计划被有防备的中俄击破，J国遭受了灭顶之灾(核导弹雨?)。在养父母和其暗恋对象们因为战争惨死后， x对周围世界彻底绝望加不再留恋，并决定改变一切，启用研究已久的私密技术，打开了时空隧道，将自己传送到二战时期，企图以一己之力改变战争的结果和实现自己的梦想：
1. 使用黑科技污染了海洋和大气，造成全世界男人肌肉萎缩，通过毁坏世界上的男性使自己成为唯一相对正常的男人，让女性屈服和只能和他繁殖，并且极大打击世界反抗力量。因此所有战舰都被迫启用女性船长和船员。(现在可以完美解释为何战舰会变成女人，女人不是战舰，乃是船长，因为和战舰命运绑定而以船名称代替自己的名字)
2. 消灭并取代了J国(反法西斯，刺杀元首什么的都可以有了)，以J国生产力为核心生产深海舰队。(因为生产环境和材料科技限制，开始只能造比较低端的船，后期逐渐多了金皮彩皮)
3. 为阻止G国和U国研究原子弹，毁坏了G国(继续反法西斯)的政府和科技，因此E国，F国力量得以较好保存，G国俾斯麦等也是流亡状态加入联军反深海，不再助纣为虐。
4. 因为3，个人憎恨和对历史的掌握，认为U国是罪魁祸首和扭转历史的关键，主要进攻U国。(战场不在C国很重要)
5. 深海舰队是用X所喜欢的对象为原型，用DNA技术快速克隆制造的，具有产量高，忠诚高但无脑的特点。(因为生产环境和材料科技限制，开始只能造比较低端的，后期逐渐多了金皮彩皮)(后期可以发展出控制深海的技术或产生部分有脑深海更爱帅哥，弃暗投明。。)
6. 基于5，X也会喜欢上某些舰娘并企图捕获她们作为原型。(掉落就是救出原型/克隆, and可以有深海罗德尼之类)
7. 部分钟爱的原型被杀，会令X陷入回忆而极度痛苦变得更加脆弱或疯狂。(弱点设置，如东方不败)
提督(玩家)：
谜一样不明身份的男子，世界上另一个没有萎缩且外形良好的男人。(因此受到广大舰娘的拥护与效忠，因为是世界上最后一个帅哥)对抗深海的总指挥官，表面目标是阻止深海之王的阴谋，恢复世界的正常(因为完全受不了女粉丝太多?)， 但其不受感染的原因和深层动机仍然是个谜……(因为……)
舰娘：
船长，船的代言人，增加星座属性和个性爱好。增加沉船剧情设定或临时控制船设定(有别离的短暂拥有才更伤怀)