自从零度禁区有生化怪物后，通往零度禁区的公路便被重兵把守，联盟军和反叛者暂且停战。可是，生化怪物们还是逃出了零度禁区，到了城市内感染更多的人。在A市有一条X街，被怪物们占领了，这条街从繁繁华华变成了一条魔都废街。在Y医院，有很多被感染了生化病毒的人躺在病床上。
小李是这个医院最好的护士，因此接管的病人最多。护士们治疗这些病人前，都得为他们打麻药，以免发生意外。一天，小李接管了一个被感染的病人。小李一看，这是她的父亲，于是，她认为父亲不会伤害她的，便没打麻药。谁知在治疗过程中，病人突然跃起，把小李感染了。
于是生化病毒就在医院传播起了!P国总统知道了此事，认为生化病毒可以给他好处，就在荒山野岭开了一块地，让自己国家的所有科学家在那里研究生化病毒，并命名那里为“秘密基地”。可是试验失败了，科学家们都变成了生化怪物，P国总统只好把秘密基地封锁起来。
谁知生化怪物们还是逃了出来。联盟军和反叛者中的专家们，特地研究出了一种“爆破LF—远程遥控型天火•C4炸弹”，把这种炸弹投放到有生化怪物的地方，“砰隆”一声，生化怪物从这个世界中消失了。