神魔之塔副本界面全面解析，按BATTLE并在7个地区中选择其中一个。然后，该地区内会显示现时可以挑战的副本列表。选择其中一个副本后会显示该副本内现时可挑战的关卡，成功挑战一个关卡后可以解封下一个关卡。当成功挑战该副本内所有关卡后，该副本会完全通过，解封下一个副本。
解封副本的次序为：水属性地区、火属性地区、 木属性地区、光属性地区、暗属性地区。在所有地区陆续解封的副本完成后，主塔会出现试炼副本，玩家完成试炼副本后才可以继续解封其他地区更高级的副本。不同属性地区只会出现相应属性的怪物，而试炼地区副本会有各种属性的怪物。
每个关卡名称的下方会显示挑战该关卡所需体力值及战斗回合数量。选择关卡后会出现可选择的战友列表，列表是由你所有朋友以及随机挑选三位冒险者组成，玩家可以从列表中选择其中一位玩家，在挑战副本时该玩家的召唤兽代表会加入你的队伍协助战斗。如果该玩家已成为你的朋友，该玩家的召唤兽代表的队长技能会生效，意思就是该次关卡挑战中，你的队伍的队长技能和朋友召唤兽代表的队长技能会同时生效。如果召唤兽代表所属玩家为冒险者，则只有你的队伍的队长技能会生效，于挑战成功后可向冒险者发送好友邀请。
神魔之塔攻略：副本界面
每次重新进入战友列表后， 系统会重新挑选三位冒险者，但是在一个时段内只会有一小部份冒险者被挑选， 所以每次重新挑选时可能会有相同的冒险者出现。当选择战友协助挑战成功后，你可以获得友情点数，选择朋友可以获得10点友情点数，选择冒险者获得5点，在选择战友协助并获得一次友情点数后，在24小时内重复选择相同战友协助不会再获得友情点数。 友情点数可以用于友情封印，每次友情封印花费200点友情点数。玩家先观看战友的召唤兽代表能力再决定选择一位合适的战友协助战斗，召唤兽代表的能力可以于战友列表中长按代表的头像观看，或是在点选其中一位玩家后出现的选单中选择“详情”。
当选择一位战友协助挑战副本并成功后，战友不会在列表再次出现，直至战友登入游戏。如果挑战失败，战友则会保留在列表中让玩家再次选择。